生物のカテゴライゼーション（分類）の歴史

全世界の生物のカテゴライゼーション（分類）の歴史は、以下のような段階を経て発展してきました。それは人類の自然認識の変遷そのものでもあり、「観察」「命名」「構造化」「進化理解」「遺伝子ベースの分類」と進化してきました。

【1】古代：経験的分類（観察と用途ベース）

• アリストテレス（紀元前4世紀）：動物を「血のあるもの（脊椎動物）」と「血のないもの（無脊椎動物）」に分け、観察に基づいて体系的に記述。
• 用途分類：薬用植物、食用動物など、文化や実用性に基づく分類が主流。

【2】中世〜ルネサンス期：神学的分類

• キリスト教神学の影響で、「神が創造した秩序」という視点から「自然の階段（Scala Naturae）」が構想される。
• 生物は静的で変化しない存在とされ、分類も固定的だった。

【3】18世紀：リンネによる二名法と階層構造の確立

• カール・フォン・リンネ（Linnaeus）：『自然の体系（Systema Naturae）』（1735年）にて、**属＋種のラテン語名（二名法）**を導入。
• 生物を「界 → 門 → 綱 → 目 → 科 → 属 → 種」という階層構造で分類。
• この体系が近代分類学（分類体系）の基礎となった。

【4】19世紀：進化論の登場と系統的分類

• ダーウィン『種の起源』（1859年）により、生物は共通祖先から進化して多様化したという理解が普及。
• 以後、分類学は系統樹（Phylogeny）ベースへ移行し、進化的関係を反映させるように。

【5】20世紀前半：形態・行動・生態に基づく分類

• 生物分類学は「形態学的特徴」や「生態的ニッチ」「行動パターン」に基づく表現型中心の分類が主流。

【6】20世紀後半：分子生物学の革命と遺伝子ベースの分類

• **DNA解析技術の登場（1970年代〜）**により、**遺伝子配列に基づく分類（分子系統学）**が発展。
• これにより、見た目が似ていても進化的に遠いもの、逆に見た目が違っても遺伝的に近いものが明らかに。

【7】1990年：ドメインという新階層の登場

• カール・ウーズ（Carl Woese）がrRNA解析により、生命を「細菌（Bacteria）・古細菌（Archaea）・真核生物（Eukarya）」の3ドメインに再分類。
• これが現代の根本的な生命体系の枠組みとなる。

【8】21世紀：メタゲノムとAIによる分類の拡張

• 土壌や海水などから直接DNAを解析するメタゲノム解析によって、培養できない未知の微生物が続々発見。
• AIによる分類支援や、生態系全体の網羅的解析が可能に。

補足：分類体系の主な変遷（略史）